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International audience

Les Systèmes d'Information Scientifique (SIS) sont des Systèmes d'Information (SI) dont le but est de produire de la connaissance et non pas de gérer ou contrôler une activité de production de biens ou de services comme les SI d'entreprise. Les SIS se caractérisent par des domaines de recherche fortement collaboratifs impliquant des équipes pluridisciplinaires et le plus souvent géographiquement éloignées, ils manipulent des données aux structures très variables dans le temps qui vont au-delà de la simple hétérogénéité : nuages de points issus de scanner 3D, modèles numériques de terrain, cartographie, publications, données issues de spectromètre de masse ou de technique de thermoluminescence, données attributaires en très grand volume, etc. Ainsi, contrairement aux bases de données d'entreprise qui sont modélisées avec des structures établies par l'activité qu'elles supportent, les données scientifiques ne peuvent pas se contenter de schémas de données pré-definis puisque la structure des données évolue rapidement de concert avec l'évolution de la connaissance. La gestion de données scientifiques nécessite une architecture de SIS ayant un niveau d'extensibilité plus élevé que dans un SI d'entreprise. Afin de supporter l'extensibilité tout en contrôlant la qualité des données mais aussi l'interopérabilité, nous proposons une architecture de SIS reposant sur : - des données référentielles fortement structurées, identifiables lors de la phase d'analyse et amenées à évoluer rarement ; - des données complémentaires multi-modèles (matricielles, cartographiques, nuages de points 3D, documentaires, etc.). Pour établir les liens entre les données complémentaires et les données référentielles, nous avons utilisé un unique paradigme, l'annotation sémantique. Nous avons proposé un modèle formel d'annotation à base ontologique pour construire des annotations sémantiques dont la cohérence et la consistance peuvent être contrôlées par une ontologie et des règles. Dans ce cadre, les annotations offrent ainsi une contextualisation des données qui permet de vérifier leur cohérence, par rapport à la connaissance du domaine. Nous avons dressé les grandes lignes d'une sémantique du processus d'annotation par analogie avec la sémantique des langages de programmation. Nous avons validé notre proposition, à travers deux collaborations pluridisciplinaires : - le projet ANR CARE (Corpus Architecturae Religiosae Europeae - IV-X saec. ANR-07- CORP-011) dans le domaine de l'archéologie. Son objectif était de développer un corpus numérique de documents multimédia sur l'évolution des monuments religieux du IVe au XIe siècle (http://care.tge-adonis.fr). Un assistant d'annotation a été développé pour assurer la qualité des annotations par rapport à la connaissance représentée dans l'ontologie. Ce projet a donné lieu au développement d'une extension sémantique pour MediaWiki ; - le projet eClims dans le domaine de la protéomique clinique. eClims est un composant clinique d'un LIMS (Laboratory Information Management System) développé pour la plate-forme de protéomique CLIPP. eClims met en oeuvre un outil d'intégration basé sur le couplage entre des modèles représentant les sources et le système protéomique, et des ontologies utilisées comme médiatrices entre ces derniers. Les différents contrôles que nous mettons en place garantissent la validité des domaines de valeurs, la complétude, la consistance des données et leur cohérence. Le stockage des annotations est assuré par une Base de Données orientées colonnes associée à une Base de Données relationnelles.

International audience; Le web sémantique et l'ouverture des données (publications, archives, référentiels) dans les sciences humaines et sociales (SHS) ont permis la création outils de recherche nouveaux permettant à la fois de créer des portails documentaires (autour de moteurs de recherche sémantiques) et des applications pouvant être embarquées dans des sites web. ISIDORE, l'accès unifié aux données, publications et informations des SHS entre dans cette catégorie. Lancé en 2010 par le CNRS et actuellement développé par Huma-Num, ISIDORE propose, outre un moteur de recherche sur le web, une collection d'applications permettant de l'utiliser de façon « embarqué » pour des usages aux plus près des besoins des enseignants-chercheurs et des étudiants.

L’étude des fonds iconographiques ou textuels relatifs aux monuments du Caire soulève des difficultés de traitement en raison des multiples variantes issues de la translittération, en caractères latins, des toponymes arabes. Le laboratoire InVisu a établi un référentiel multilingue arabe, français et anglais, qui propose une solution innovante pour identifier, décrire et localiser les 600 édifices classés du Caire. Ce thésaurus est publié au format SKOS (Simple Knowledge Organization System) et aligné sur des jeux de données de référence (data.bnf, Library of Congress, Getty, DBpedia, VIAF et GeoNames).

International audience; Cette publication des Dossiers d’HEL, supplément électronique à la revue HEL, comporte huit articles issus des communications du colloque SHESL-HTL 2015 « Corpus et constitution des savoirs linguistiques ». Ce colloque a eu lieu les 30 et 31 janvier 2015 à Paris et a été co-organisé par la SHESL, le laboratoire d’Histoire des Théories Linguistiques (UMR 7597) et le Laboratoire Ligérien de Linguistique (UMR 7270), sous la direction de Gabriel Bergounioux, Bernard Colombat et Jacqueline Léon (cf. l’appel à colloque et le programme [http://www.shesl.org/spip.php?rubrique76]). Une autre partie des communications a fait l’objet d’une publication dans le numéro XXXVIII/2 d’Histoire Épistémologie Langage, « Corpus et constitution des savoirs linguistiques et pérennisation des données » (décembre 2016). Nous en donnons la liste à la fin de cette présentation.

L'accès aux données primaires, particulièrement en archéologie et en archéosciences, reste encore limité. Cette question est pourtant un enjeu majeur de la recherche scientifique. Le Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique (LaMPEA-UMR 7269), au sein du réseau des laboratoires d'archéologie du périmètre d'Aix Marseille Université, porte le développement d'une plateforme numérique collaborative et interdisciplinaire ArcaDIIS (Archaeological Data Infrastructure for Interoperability and Sharing), pour l'interopérabilité et le partage des données de l'archéologie et des disciplines qui y sont rattachées, notamment dans les domaines de l'environnement, de l'archéométrie, des sciences de la vie et de la santé. Adoptant les technologies du web sémantique, les standards internationaux d'interopérabilité et les vocabulaires spécialisés de disciplines, cette plateforme entend répondre aux besoins en gestion qualitative de ressources. Elle propose l'éditorialisation et la valorisation des jeux de données, dans une perspective de pérennisation, d'accessibilité et de réutilisation. Elle envisage en outre d'accueillir des ressources documentaires et de modélisation aux formats spécifiques et des publications évaluées, qu'elles soient liées aux jeux de données versés sur ArcaDIIS ou produites indépendamment tout au long du cycle de vie d'un projet/programme de recherche. Access to primary data, particularly in archaeology and archaeosciences, remains limited. However, this question is a major issue in scientific research. The Laboratoire méditerranéen de préhistoire Europe-Afrique (LaMPEA-UMR 7269), within the network of archaeology laboratories in the Aix Marseille University area, is developing a collaborative and interdisciplinary digital platform ArcaDIIS (Archaeological Data Infrastructure for Interoperability and Sharing), for the interoperability and sharing of archaeology data and related disciplines, particularly in the fields of the environment, archaeometry, life sciences and health. Adopting semantic web technologies, international interoperability standards and specialized disciplinary vocabularies, this platform aims to meet the needs of qualitative resource management. It proposes the editorialization and enhancement of data sets, with a view to sustainability, accessibility and reuse. It also plans to host documentation and modelling resources in specific formats and evaluated publications, whether related to the data sets on ArcaDIIS or produced independently throughout the life cycle of a research project/program.Translated with www.DeepL.com/Translator

Huma-Num is a Very Large Research Infrastructure (known by its initials in French as TGIR) led by the French Ministry of Higher Education and Research and operated by the CNRS (the French National Centre for Scientific Research).It provides services to the entire Humanities and Social Sciences (HSS) academic community and particularly digital services that are focused on research data management with the aim of helping researchers manage the lifecycle of their data.Huma-Num has designed and provided to the community a new storage service for large volumes (several terabytes) of cold or warm data, so-called because it is rarely accessed or modified, but which does have a high value and therefore needs to be safely secured.How the project was designed, the desired outcomes compared with the previous solution (iRods), the selected solution (Active-Circle software on generally-available hardware), the features of the solution, the network architecture implemented (deployment on RENATER through VPN) and the integration with an LDAP directory will be presented.The collaboration that has been set up with the MSH (Houses of the Human Sciences), the information systems directorates of the affiliated universities and with RENATER will also be described.A progress report on the deployment of the project in seven points of presence in France will be provided, and the project’s development opportunities will be pointed out. Huma-Num est une Très Grande Infrastructure de Recherche (TGIR) pilotée par le Ministère de l'enseigne-ment supérieur et de la recherche, et opérée par le CNRS. Elle rend des services à l'ensemble de la communauté académique en Sciences Humaines et Sociales (SHS) et notamment des services numériques, orientés sur la gestion des données de la recherche, ceci dans le but d'aider les chercheurs à gérer la vie de leurs données. Huma-Num a conçu et proposé à la communauté un nouveau service de stockage nommé Huma-Num Box et destiné aux gros volumes de données (plusieurs To) dites « froides » ou « tièdes », c'est-à-dire peu accédées et modifiées, mais à forte valeur et donc nécessitant une sécurisation importante. Il sera exposé la façon dont le projet a été conçu, les objectifs recherchés par rapport à la solution pré-cédente (iRods), la solution retenue (logiciel Active-Circle sur matériel banalisé), les fonctionnalités de la solution, l'architecture réseau mise en oeuvre (déploiement sur RENATER au travers de VPN) et l'intégra-tion avec un annuaire LDAP. Il sera également indiqué les collaborations qui ont été mises en place avec les Maisons des Sciences de l'Homme (MSH), les DSI des universités de rattachement, et RENATER. Il sera fait un point d'étape sur le déploiement du projet dans 7 points de présence sur le territoire, et indiqué les perspectives d'évolution du projet.

International audience; Ce guide de bonnes pratiques éthiques et juridiques pour la diffusion des données en SHS est né de la réflexion d’un groupe de chercheurs, de professionnels de la documentation et de juristes structuré dans le cadre d’un groupe de travail Éthique et Droit. Face au renouvellement des problématiques liées aux droits d’auteurs, à la confidentialité, à la sécurisation et à la validation des données dans un contexte de mutation technologique, le groupe de travail Éthique et Droit a lancé un appel à communication ouvert à toutes les personnes s’intéressant aux problématiques éthiques et juridiques en matière de diffusion des données en SHS. Les auteurs ont été invités à proposer soit des retours d’expériences soit des articles portant sur les enjeux éthiques et juridiques en matière de diffusion des données en SHS, en explorant les solutions concrètes envisageables ou envisagées dans le cadre des cinq étapes de diffusion identifiées au préalable : la préparation de la recherche et l’anticipation de l’archivage ; la collecte des données ; le traitement, l’archivage et la description des données ; la diffusion des résultats de la recherche et la réutilisation des données.Il est important ici de souligner le caractère ambitieux de la démarche, à la fois prospective et réflexive, empirique et comparative, et surtout résolument pragmatique. Ce projet, labellisé par la Digital Research Infrastructure for the Arts and Humanities (DARIAH) en 2015 et financé par le Service commun de documentation (SCD) d’AMU, par la MMSH et par le consortium des ethnologues de la Très Grande Infrastructure de recherche (TGIR) Huma-Num a été supervisé par un comité scientifique qui s’est porté garant de la rigueur scientifique de la démarche.

International audience; En guise de postface, il nous a semblé nécessaire de revenir sur le processus collaboratif de la fabrication de cet ouvrage et de vous confier la genèse de ce projet. Tout est parti d'un constat pragmatique, de nos situations quotidiennes de travail : le/la chercheur·e qui produit ou utilise des données a besoin de réponses concrètes aux questions auxquelles il/elle est confronté·e sur son terrain comme lors de tous ses travaux de recherche. Produire, exploiter, diffuser, partager ou éditer des sources numériques fait aujourd'hui partie de notre travail ordinaire. La rupture apportée par le développement du web et l'arrivée du format numérique ont largement facilité la diffusion et le partage des ressources (documentaires, textuelles, photographiques, sonores ou audiovisuelles...) dans le monde de la recherche et, au-delà, auprès des citoyens de plus en plus curieux et intéressés par les documents produits par les scientifiques.