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Les Systèmes d'Information Scientifique (SIS) sont des Systèmes d'Information (SI) dont le but est de produire de la connaissance et non pas de gérer ou contrôler une activité de production de biens ou de services comme les SI d'entreprise. Les SIS se caractérisent par des domaines de recherche fortement collaboratifs impliquant des équipes pluridisciplinaires et le plus souvent géographiquement éloignées, ils manipulent des données aux structures très variables dans le temps qui vont au-delà de la simple hétérogénéité : nuages de points issus de scanner 3D, modèles numériques de terrain, cartographie, publications, données issues de spectromètre de masse ou de technique de thermoluminescence, données attributaires en très grand volume, etc. Ainsi, contrairement aux bases de données d'entreprise qui sont modélisées avec des structures établies par l'activité qu'elles supportent, les données scientifiques ne peuvent pas se contenter de schémas de données pré-definis puisque la structure des données évolue rapidement de concert avec l'évolution de la connaissance. La gestion de données scientifiques nécessite une architecture de SIS ayant un niveau d'extensibilité plus élevé que dans un SI d'entreprise. Afin de supporter l'extensibilité tout en contrôlant la qualité des données mais aussi l'interopérabilité, nous proposons une architecture de SIS reposant sur : - des données référentielles fortement structurées, identifiables lors de la phase d'analyse et amenées à évoluer rarement ; - des données complémentaires multi-modèles (matricielles, cartographiques, nuages de points 3D, documentaires, etc.). Pour établir les liens entre les données complémentaires et les données référentielles, nous avons utilisé un unique paradigme, l'annotation sémantique. Nous avons proposé un modèle formel d'annotation à base ontologique pour construire des annotations sémantiques dont la cohérence et la consistance peuvent être contrôlées par une ontologie et des règles. Dans ce cadre, les annotations offrent ainsi une contextualisation des données qui permet de vérifier leur cohérence, par rapport à la connaissance du domaine. Nous avons dressé les grandes lignes d'une sémantique du processus d'annotation par analogie avec la sémantique des langages de programmation. Nous avons validé notre proposition, à travers deux collaborations pluridisciplinaires : - le projet ANR CARE (Corpus Architecturae Religiosae Europeae - IV-X saec. ANR-07- CORP-011) dans le domaine de l'archéologie. Son objectif était de développer un corpus numérique de documents multimédia sur l'évolution des monuments religieux du IVe au XIe siècle (http://care.tge-adonis.fr). Un assistant d'annotation a été développé pour assurer la qualité des annotations par rapport à la connaissance représentée dans l'ontologie. Ce projet a donné lieu au développement d'une extension sémantique pour MediaWiki ; - le projet eClims dans le domaine de la protéomique clinique. eClims est un composant clinique d'un LIMS (Laboratory Information Management System) développé pour la plate-forme de protéomique CLIPP. eClims met en oeuvre un outil d'intégration basé sur le couplage entre des modèles représentant les sources et le système protéomique, et des ontologies utilisées comme médiatrices entre ces derniers. Les différents contrôles que nous mettons en place garantissent la validité des domaines de valeurs, la complétude, la consistance des données et leur cohérence. Le stockage des annotations est assuré par une Base de Données orientées colonnes associée à une Base de Données relationnelles.

Les archives scientifiques sont des archives hybrides qui commencent à être traitées dans l'enseignement supérieur, et notamment en SHS, après avoir longtemps été en souffrance. Ce travail dresse un état de l'art sur la question tant au niveau de la réflexion que sur les modes d'organisation et de traitement de ces archives. The scientific and academic archives in humanities are, amongst the French higher education system, a quite new matter. This essay is a report of the situation of those archives, especially the ways of defining and organizing them.

Au vu des risques que créée l’obsolescence technologique, l’archivage pérenne des contenus numériques s’avère désormais incontournable et constitue un enjeu pour l’Enseignement supérieur et la Recherche. La préservation à très long terme nécessite cependant des compétences et des techniques spécifiques et implique des coûts, humains et financiers. Pour la bibliothèque universitaire se pose alors la question du rôle qui doit être le sien au regard de l’archivage pérenne des contenus numériques qu’elle est amenée à stocker, à diffuser ou à produire. L’objectif de ce mémoire est de dresser un panorama de l’archivage pérenne dans l’Enseignement supérieur et la Recherche, de présenter et d’analyser un ensemble de retours d’expérience de bibliothèques universitaires ayant mené à bien, ou mettant actuellement en oeuvre, ou encore envisageant un projet d’archivage pérenne, et d’en déduire les difficultés et les obstacles qui s’opposent à une réelle avancée de l’archivage pérenne en bibliothèque universitaire. Le mémoire envisagera la mutualisation, à divers niveaux, comme une réponse à ces difficultés. As a result of technological obsolescence, nowadays long-term archiving proves to be unavoidable and represents an issue in the field of Higher Education and Research. Nevertheless, long-term preservation requires specific skills and technics, as it implies human and financial costs. Academic libraries have then to define their role regarding long-term archiving of the digital contents they usually store, broadcast or produce. The goal of this report is to give an updated overview of long-term archiving in the field of Higher Education and Research, to present and analyse a set of feedbacks from French academic libraries having completed successfully or being considering a long term archival project, and to deduce the difficulties and obstacles which are opposed to a significant progress in long-term archiving in academic libraries. The report will consider different levels of resource sharing as a response to these difficulties.

Conférence invitée, voir la vidéo de la présentation : http://videocampus.univ-bpclermont.fr/?v=SXX3gjZtTjYZ , à partir du temps : 00:17:46; Le monde universitaire est producteur de données de différentes natures. L'ouverture et le partage de chaque type de données introduit des problématiques spécifiques. Cette variété s'explique en premier lieu par les situations particulières qui ont gouverné leur création. Mais les enjeux d'utilisation, par les communautés universitaires, les communautés de chercheurs ou la société en général, diffèrent aussi suivant chaque type de données. Nous évoquerons brièvement un premier type de données, celles pédagogiques, en lien avec le mouvement en accès libre intitulé Open Educational Ressources (OER). Le second type de données, cette fois faisant partie du résultat de la recherche, concerne les publications. Notre communication rappellera brièvement, afin de mieux les distinguer du dernier type de données, les contraintes particulières qui ont motivé le développement de l'accès libre (open access) aux publications, les différentes voies suivies, l'état actuel après plus de 10 ans d'existence. L'essentiel de notre propos sera consacré au partage des données de la recherche, qui peuvent ou non être reliées aux publications. Nous décrirons les motivations de ce mouvement OpenData, les enjeux pour les chercheurs, les conditions particulières de mise à disposition que devront avoir ces données pour être réellement OpenData. Nous évoquerons enfin les transformations profondes du métier de chercheur qui peuvent en résulter, en nous appuyant sur des exemples provenant principalement des sciences humaines.

Dans ce travail, nous formulons un certain nombre de propositions relatives à l'amélioration des flux d'information au sein des infrastructures organisant les relations entre les bibliothèques numériques. Cette question des flux, liée aux possibilités à la fois techniques et sociales de structuration des relations entre les collections des différentes bibliothèques, ne trouve pas une réponse seulement en matière d'ingénierie. Nous voulons montrer en quoi une démarche pluridisciplinaire amène à proposer des concepts et un modèle formulés de façon satisfaisante par rapport aux usages.Notre travail se présente à la fois comme un travail théorique à propos de la définition de l'information, méthodologique dans la démarche de prise en compte de phénomènes existants et observables, pour la formulation de propositions modélisées, et enfin ouvrant la voie à des améliorations concernant l'accès à l'information. In fine, de par la mise en évidence de nouvelles relations entre les documents, nos propositions visent à augmenter la précision des réponses dans le cadre de la recherche d'information par une amélioration de description des documents. Pour cela, nous présentons en fin de travail un projet que nous menons actuellement et qui constitue une première application, parmi d'autres possibles, du modèle présenté.

This article presents a study of the French-speaking digital humanities. It is based on the experience of two research engineers from the French National Center for Scientific Research (CNRS) who have been studying these issues for the last ten years. They conducted a survey at the École Normale Supérieure (ENS-Paris) which enabled them to draw up an overview of the transformation of the profession of humanities and social sciences research engineers in the context of the digital humanities. The Digit_Hum initiative, which they run in parallel with their respective activities at the ENS, also provided information for this overview thanks to its role as a space for discussion about the digital humanities along with training and structuring of this field at the ENS and the Université Paris Sciences & Lettres (PSL). Cet article est une réflexion sur les humanités numériques en contexte francophone. Elle s’appuie sur l'expérience de deux ingénieures du Centre National de la Recherche Scientifique travaillant sur ces questions depuis une dizaine d'années. À travers l'enquête qu'elles ont menée à l'École normale supérieure (ENS-Paris), elles dressent un panorama de la transformation du métier d'ingénieur(e) en sciences humaines et sociales dans le contexte des humanités numériques. L'initiative Digit_Hum, qu'elles animent en parallèle de leurs activités respectives à l'École, nourrit également ce témoignage en constituant un espace de discussions, de formations et de structuration des humanités numériques au sein de l'ENS et de l’Université Paris Sciences & Lettres.